More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0029 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
171 aa  348  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  94.74 
 
 
171 aa  335  2e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  70.99 
 
 
168 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  7.41924e-09 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  66.06 
 
 
167 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  58.49 
 
 
162 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  56.05 
 
 
158 aa  173  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  56.05 
 
 
158 aa  173  1e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  47.8 
 
 
158 aa  157  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  60.68 
 
 
190 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  57.38 
 
 
190 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  60.33 
 
 
168 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  50.63 
 
 
176 aa  134  7e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  47.9 
 
 
161 aa  132  2e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  47.31 
 
 
161 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  47.31 
 
 
161 aa  129  1e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  46.88 
 
 
159 aa  128  4e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  45.62 
 
 
159 aa  126  1e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  45 
 
 
159 aa  124  4e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  54.47 
 
 
147 aa  125  4e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  44.64 
 
 
162 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  46.58 
 
 
195 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  53.04 
 
 
158 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  47.8 
 
 
176 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  43.5 
 
 
181 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  43.75 
 
 
161 aa  120  1e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  48.25 
 
 
200 aa  120  1e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  45 
 
 
157 aa  118  4e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  43.48 
 
 
154 aa  117  5e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  62.07 
 
 
169 aa  118  5e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  49.17 
 
 
185 aa  117  8e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  57.98 
 
 
167 aa  117  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  41.92 
 
 
160 aa  116  1e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  39.75 
 
 
160 aa  116  1e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  52.21 
 
 
157 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.11 
 
 
161 aa  117  1e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  52.21 
 
 
157 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  52.21 
 
 
157 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  52.21 
 
 
157 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  39.26 
 
 
158 aa  115  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  42.24 
 
 
154 aa  115  2e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  48.8 
 
 
168 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  43.83 
 
 
157 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  41.25 
 
 
154 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  51.33 
 
 
157 aa  115  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  114  7e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  41.88 
 
 
162 aa  112  2e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  41.61 
 
 
154 aa  112  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  55.28 
 
 
195 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  40.24 
 
 
168 aa  110  7e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  40.99 
 
 
154 aa  110  7e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  50.4 
 
 
194 aa  110  8e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  39.75 
 
 
153 aa  110  1e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  40.24 
 
 
160 aa  109  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  49.19 
 
 
167 aa  109  2e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  50.83 
 
 
174 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  54.17 
 
 
163 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  46.55 
 
 
158 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  52.1 
 
 
166 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  47.46 
 
 
161 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  5.94068e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  38.65 
 
 
157 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 
165 aa  107  9e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  50 
 
 
158 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  50.83 
 
 
167 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  38.65 
 
 
156 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  51.24 
 
 
169 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  36.81 
 
 
155 aa  106  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  55.65 
 
 
205 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  38.99 
 
 
158 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  39.19 
 
 
185 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.03125e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  41.88 
 
 
159 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  42.68 
 
 
151 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  43.12 
 
 
155 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  43.12 
 
 
155 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  48.31 
 
 
137 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  43.12 
 
 
155 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  37.89 
 
 
156 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  43.83 
 
 
157 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  45.38 
 
 
154 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  42.5 
 
 
155 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  43.12 
 
 
155 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  46.91 
 
 
159 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  45.76 
 
 
161 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  36.59 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  45.76 
 
 
161 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  37.11 
 
 
155 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  42.54 
 
 
154 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  40.5 
 
 
158 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  46.34 
 
 
171 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  40.5 
 
 
158 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  43.21 
 
 
157 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  40.74 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  43.83 
 
 
157 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  43.83 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  50.86 
 
 
153 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  44.25 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>