More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0028 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  100 
 
 
377 aa  749  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  93.23 
 
 
383 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  72.65 
 
 
391 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  1.14145e-09 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  63.07 
 
 
345 aa  406  1e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  54.57 
 
 
373 aa  362  5e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  55.12 
 
 
374 aa  342  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  58.28 
 
 
342 aa  337  3e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  54.49 
 
 
353 aa  327  1e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  50.77 
 
 
373 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.78 
 
 
340 aa  288  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  46.21 
 
 
420 aa  287  3e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  46.97 
 
 
377 aa  282  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  49.55 
 
 
389 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  48.92 
 
 
382 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  48.92 
 
 
382 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  48.92 
 
 
384 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  48.12 
 
 
374 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  47.84 
 
 
376 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  47.98 
 
 
375 aa  274  2e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  45.43 
 
 
381 aa  273  4e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  47.84 
 
 
375 aa  272  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  49.05 
 
 
386 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  46.51 
 
 
357 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  46.85 
 
 
344 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  44.11 
 
 
324 aa  254  2e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  43.73 
 
 
319 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  42.81 
 
 
296 aa  183  5e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  39.23 
 
 
302 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 
300 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  36.6 
 
 
314 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39 
 
 
315 aa  175  1e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39 
 
 
315 aa  175  1e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  34.58 
 
 
324 aa  175  1e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  40 
 
 
312 aa  174  3e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
318 aa  173  4e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  35.67 
 
 
322 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 
304 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.14 
 
 
421 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
289 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  31.56 
 
 
371 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  35.87 
 
 
313 aa  149  1e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.67 
 
 
299 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  33.45 
 
 
314 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
275 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  29.91 
 
 
292 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  38.08 
 
 
310 aa  140  5e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  29.28 
 
 
286 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
296 aa  139  8e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  31.56 
 
 
299 aa  139  9e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.85 
 
 
434 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  30.31 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.5 
 
 
433 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
292 aa  137  3e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  28.93 
 
 
287 aa  137  3e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  27.62 
 
 
298 aa  137  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  28.93 
 
 
287 aa  136  6e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.8 
 
 
426 aa  135  1e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  30.47 
 
 
259 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
291 aa  133  4e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  28.74 
 
 
291 aa  133  4e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.56 
 
 
292 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.61 
 
 
284 aa  133  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.16 
 
 
430 aa  132  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  28.26 
 
 
293 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  28.1 
 
 
284 aa  131  2e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
291 aa  131  2e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.42 
 
 
291 aa  131  2e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  31.21 
 
 
285 aa  131  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  32.6 
 
 
284 aa  130  4e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.39521e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  28.88 
 
 
292 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 
439 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.5 
 
 
295 aa  129  6e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  28.53 
 
 
285 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 
425 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  129  7e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  30.98 
 
 
293 aa  129  7e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  129  1e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
291 aa  129  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  29.41 
 
 
295 aa  128  1e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.39 
 
 
420 aa  129  1e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  31.54 
 
 
279 aa  128  1e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  129  1e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 
435 aa  128  2e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  33.47 
 
 
442 aa  127  2e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  27.43 
 
 
258 aa  128  2e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 
291 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  29.5 
 
 
291 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07663e-09 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.54 
 
 
279 aa  128  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  28.53 
 
 
285 aa  128  2e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
291 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  28.66 
 
 
273 aa  127  4e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  29.57 
 
 
291 aa  127  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  29.57 
 
 
291 aa  127  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.41 
 
 
464 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  28.82 
 
 
311 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 
250 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.31 
 
 
403 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>