172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0026 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  100 
 
 
96 aa  194  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  70.97 
 
 
103 aa  138  2e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  70.45 
 
 
111 aa  129  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  67.82 
 
 
115 aa  127  4e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  68.54 
 
 
110 aa  127  4e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  67.82 
 
 
115 aa  127  4e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  67.82 
 
 
115 aa  127  4e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  67.05 
 
 
106 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  67.05 
 
 
106 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  69.89 
 
 
104 aa  125  2e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  69.89 
 
 
104 aa  125  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  67.03 
 
 
107 aa  123  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  64.77 
 
 
110 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  66.28 
 
 
95 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  64.29 
 
 
105 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  63.74 
 
 
104 aa  117  5e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  67.44 
 
 
114 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  68.67 
 
 
94 aa  115  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  64.37 
 
 
96 aa  116  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  70 
 
 
108 aa  115  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  64.77 
 
 
129 aa  112  2e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  60.23 
 
 
119 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  63.22 
 
 
135 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  58.24 
 
 
114 aa  111  4e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  63.22 
 
 
147 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  64.1 
 
 
120 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  54.55 
 
 
141 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  60.76 
 
 
98 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  60.26 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  56.96 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  58.97 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  58.97 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  57.69 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  58.97 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  44.58 
 
 
129 aa  80.1  9e-15  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  43.53 
 
 
113 aa  79  2e-14  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  60.8  5e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  60.5  7e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  60.5  7e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  60.5  7e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  60.5  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.08785e-05  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.76639e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  43.06 
 
 
373 aa  59.7  1e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.67 
 
 
373 aa  58.5  3e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 
373 aa  57.8  4e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 
373 aa  58.2  4e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 
373 aa  57.8  5e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 
384 aa  57  8e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.66 
 
 
375 aa  57  9e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 
373 aa  57  1e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 
373 aa  57  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 
373 aa  57  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
375 aa  55.5  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40 
 
 
381 aa  55.8  2e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  34.62 
 
 
375 aa  55.5  3e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 
374 aa  54.3  5e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
377 aa  54.3  6e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  29.27 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.34 
 
 
358 aa  53.1  1e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
375 aa  52  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  35.44 
 
 
121 aa  51.2  5e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 
358 aa  51.2  5e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  34.12 
 
 
386 aa  50.8  6e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.7938e-09  hitchhiker  6.00467e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
379 aa  50.8  6e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  41.54 
 
 
359 aa  50.8  7e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
379 aa  50.4  7e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.7 
 
 
358 aa  50.4  8e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  38.16 
 
 
105 aa  50.1  1e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.11 
 
 
379 aa  49.7  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
384 aa  48.9  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
383 aa  49.7  2e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
379 aa  48.9  2e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.0953e-05  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
383 aa  48.9  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
383 aa  48.9  3e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 
375 aa  48.5  3e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
379 aa  48.5  3e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
384 aa  48.5  3e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
383 aa  48.9  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 
379 aa  48.9  3e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 
379 aa  48.9  3e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  32.47 
 
 
456 aa  47.8  5e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  41.79 
 
 
372 aa  47.8  5e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 
379 aa  47.4  7e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.55 
 
 
399 aa  47  8e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  43.86 
 
 
381 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  40.74 
 
 
294 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  28.57 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.53 
 
 
371 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  29.55 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 
383 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.67 
 
 
372 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  40 
 
 
359 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.59 
 
 
393 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>