238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0025 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
153 aa  313  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  67.36 
 
 
151 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  56.25 
 
 
151 aa  162  1e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  54.86 
 
 
151 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.17 
 
 
151 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  54.86 
 
 
149 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  52.78 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  52.78 
 
 
151 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  52.45 
 
 
151 aa  150  6e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  47.97 
 
 
149 aa  126  9e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.94 
 
 
148 aa  125  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
143 aa  120  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.45 
 
 
163 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.36 
 
 
146 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.01 
 
 
143 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4015  carboxymuconolactone decarboxylase  45.58 
 
 
151 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0483947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.1 
 
 
163 aa  112  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.18 
 
 
143 aa  112  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
145 aa  112  2e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
143 aa  112  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.41 
 
 
163 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.42 
 
 
143 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.73 
 
 
146 aa  110  7e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  108  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  108  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 
152 aa  109  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 
153 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
153 aa  108  4e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 
162 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.26 
 
 
145 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 
145 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 
153 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.26 
 
 
149 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.26 
 
 
145 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.26 
 
 
157 aa  107  8e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
159 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.73 
 
 
152 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  35.86 
 
 
167 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.56 
 
 
145 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.58 
 
 
159 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.19 
 
 
153 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
145 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 
145 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
145 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  34.69 
 
 
159 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  36.17 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.74468e-15 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
150 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
150 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
150 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
150 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
150 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
144 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
144 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.57 
 
 
155 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.93 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.58 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.73 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.11 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
145 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  39.44 
 
 
145 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.56 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.19 
 
 
283 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.57 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.73 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.64 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.73 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  38.73 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.27 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.06 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.39 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.39 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.27 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.43 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.76 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.57 
 
 
159 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 
154 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.34 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
151 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.03 
 
 
159 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  38.46 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>