More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0018 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
420 aa  866  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  57.41 
 
 
401 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  57.07 
 
 
401 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  50.53 
 
 
388 aa  357  2e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
396 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  35.41 
 
 
391 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  31.5 
 
 
404 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 
426 aa  202  1e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  34.49 
 
 
416 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.18 
 
 
399 aa  197  2e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 
425 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.25 
 
 
466 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 
424 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
399 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
410 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 
421 aa  184  2e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
407 aa  182  8e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
406 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.99 
 
 
405 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
379 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
517 aa  165  2e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
405 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  31.59 
 
 
411 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.81 
 
 
411 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 
464 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  31.53 
 
 
348 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  32.15 
 
 
427 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
406 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
370 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 
400 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.64 
 
 
465 aa  148  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 
381 aa  148  2e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
447 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
447 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 
367 aa  142  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 
367 aa  140  5e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 
401 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
424 aa  134  2e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  24.75 
 
 
450 aa  127  4e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 
494 aa  126  8e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  30.05 
 
 
358 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
607 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  3.36338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.41 
 
 
585 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  38.97 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.4 
 
 
284 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.07 
 
 
483 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.19 
 
 
483 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.55 
 
 
614 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
586 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
645 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.81 
 
 
638 aa  90.5  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
741 aa  90.1  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 
641 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.15 
 
 
479 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.49 
 
 
645 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.93 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 
903 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  25.41 
 
 
971 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
348 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.29 
 
 
672 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
859 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.81 
 
 
656 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
1207 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 
403 aa  86.3  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 
864 aa  85.9  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.09 
 
 
729 aa  85.1  2e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.92 
 
 
588 aa  85.1  2e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
681 aa  85.1  2e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
348 aa  85.1  2e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.43 
 
 
737 aa  85.1  2e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.21 
 
 
604 aa  85.1  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  29.65 
 
 
969 aa  84.3  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
744 aa  84.7  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30 
 
 
723 aa  84.3  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  34.54 
 
 
437 aa  83.6  5e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
858 aa  84  5e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  34.54 
 
 
437 aa  83.6  6e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 
860 aa  83.6  6e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 
1133 aa  83.2  8e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  26.98 
 
 
725 aa  83.2  8e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.37 
 
 
797 aa  82.4  1e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  31.45 
 
 
632 aa  82.8  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 
1130 aa  82.4  1e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
1153 aa  81.6  2e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 
675 aa  82  2e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 
546 aa  82  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.36 
 
 
441 aa  82  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  28.5 
 
 
431 aa  82  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
536 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.15 
 
 
1020 aa  81.6  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.7 
 
 
529 aa  81.3  3e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.22 
 
 
757 aa  81.3  3e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.37 
 
 
584 aa  80.9  4e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.82 
 
 
723 aa  80.9  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
1160 aa  80.9  4e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
462 aa  80.5  5e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 
699 aa  80.1  7e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 
740 aa  80.1  8e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.57 
 
 
758 aa  79.7  9e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>