More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0015 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  88.81 
 
 
412 aa  713  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  74.76 
 
 
426 aa  636  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  80.34 
 
 
421 aa  681  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  98.78 
 
 
412 aa  830  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  89.08 
 
 
426 aa  744  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  1.50767e-09 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
412 aa  841  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  6.16083e-05 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  79.86 
 
 
420 aa  675  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  83.97 
 
 
426 aa  669  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  80.58 
 
 
421 aa  682  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  71.43 
 
 
398 aa  571  1e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  68.28 
 
 
398 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  68.52 
 
 
398 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  68.13 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  67.31 
 
 
398 aa  540  1e-152  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  67.8 
 
 
398 aa  540  1e-152  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  67.31 
 
 
398 aa  538  1e-152  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  67.07 
 
 
398 aa  538  1e-152  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  68.46 
 
 
392 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  68.7 
 
 
397 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  68.22 
 
 
392 aa  518  1e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  67.24 
 
 
392 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  67.4 
 
 
391 aa  506  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  67.16 
 
 
391 aa  506  1e-142  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  67.16 
 
 
391 aa  506  1e-142  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
394 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  62.29 
 
 
389 aa  491  1e-138  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  66.01 
 
 
393 aa  493  1e-138  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 
393 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 
389 aa  466  1e-130  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
388 aa  465  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  62.93 
 
 
388 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  62.93 
 
 
388 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 
395 aa  458  1e-128  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  61.12 
 
 
388 aa  459  1e-128  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
388 aa  452  1e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  60.88 
 
 
395 aa  451  1e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  57.62 
 
 
406 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  59.47 
 
 
402 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  59.76 
 
 
407 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  59.04 
 
 
401 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  53.55 
 
 
393 aa  406  1e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  53.01 
 
 
393 aa  406  1e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  51.24 
 
 
393 aa  404  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  52.77 
 
 
393 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  53.06 
 
 
393 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  53.3 
 
 
393 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  51.72 
 
 
392 aa  403  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  52.17 
 
 
393 aa  401  1e-110  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  52.29 
 
 
395 aa  398  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  50.97 
 
 
393 aa  398  1e-110  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  51.59 
 
 
387 aa  401  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  51.1 
 
 
388 aa  401  1e-110  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  52.35 
 
 
390 aa  400  1e-110  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  52.08 
 
 
393 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  53.06 
 
 
403 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  51.59 
 
 
387 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  52.46 
 
 
393 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  53.53 
 
 
395 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  53.53 
 
 
395 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  53.53 
 
 
395 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  50.12 
 
 
385 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  52.8 
 
 
396 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  53.53 
 
 
395 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0085  methionine adenosyltransferase  50.24 
 
 
388 aa  381  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.486268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  50 
 
 
387 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  53.43 
 
 
407 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  50.61 
 
 
389 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  52.66 
 
 
396 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  52.42 
 
 
395 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  50.71 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.2915e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  51.82 
 
 
389 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  1.99833e-06 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  51.82 
 
 
389 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  48.69 
 
 
396 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  6.96498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
396 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  52.8 
 
 
395 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
395 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  52.1 
 
 
390 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  52.83 
 
 
387 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  52.8 
 
 
396 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  51.98 
 
 
382 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  53.04 
 
 
395 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  50.24 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  51.63 
 
 
420 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
399 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  51.36 
 
 
391 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  50.24 
 
 
399 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  50.48 
 
 
399 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>