39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0012 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  87.5 
 
 
88 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  86.36 
 
 
94 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  62.5 
 
 
89 aa  109  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  56.82 
 
 
94 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  59.09 
 
 
88 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  56.82 
 
 
95 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  55.68 
 
 
89 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  57.53 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  60.27 
 
 
93 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  60.27 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  59.46 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  59.09 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  54.32 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  57.95 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  55.68 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3228  hypothetical protein  55.68 
 
 
89 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0790385  hitchhiker  7.20157e-06 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  56.34 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  61.36 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  56.34 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  56.16 
 
 
102 aa  81.6  3e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  53.66 
 
 
100 aa  81.6  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  56.16 
 
 
90 aa  78.6  3e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  52.11 
 
 
89 aa  77.8  5e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  56.16 
 
 
90 aa  74.3  6e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  53.52 
 
 
92 aa  70.1  1e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  48.81 
 
 
109 aa  68.9  2e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  43.33 
 
 
91 aa  60.1  9e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  51.69 
 
 
89 aa  58.5  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  47.62 
 
 
89 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.36585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  44.71 
 
 
108 aa  55.8  2e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  47.62 
 
 
87 aa  54.7  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  52.4  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  46.43 
 
 
97 aa  47.4  6e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  46.43 
 
 
97 aa  47.4  6e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  46.43 
 
 
97 aa  47.4  6e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  43.66 
 
 
74 aa  47  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  51.56 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>