25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0011 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  100 
 
 
85 aa  177  6e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  96.47 
 
 
85 aa  171  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  81.18 
 
 
85 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  71.76 
 
 
85 aa  138  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  4.57362e-08 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  51.32 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  51.32 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  47.37 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  45.12 
 
 
88 aa  83.2  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  46.05 
 
 
88 aa  82.8  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  42.05 
 
 
88 aa  82  2e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  47.37 
 
 
85 aa  82  2e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  46.05 
 
 
88 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  46.05 
 
 
89 aa  79.7  1e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  43.59 
 
 
94 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  46.05 
 
 
98 aa  79  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  43.42 
 
 
88 aa  78.2  3e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  44.74 
 
 
88 aa  78.2  4e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  45 
 
 
93 aa  77.8  5e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  45 
 
 
93 aa  77.8  5e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  43.59 
 
 
87 aa  77.4  6e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  42.17 
 
 
83 aa  76.6  1e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  46.48 
 
 
87 aa  76.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  44.74 
 
 
83 aa  74.7  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  36.23 
 
 
75 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>