224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0010 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
141 aa  283  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  97.87 
 
 
141 aa  277  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  81.82 
 
 
143 aa  242  1e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  5.15794e-08 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  72.34 
 
 
141 aa  216  8e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  69.29 
 
 
160 aa  208  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  69.29 
 
 
160 aa  208  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  70.5 
 
 
140 aa  207  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  68.84 
 
 
141 aa  199  1e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
141 aa  199  1e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  67.39 
 
 
141 aa  198  2e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  65.94 
 
 
141 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  67.39 
 
 
141 aa  196  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  66.91 
 
 
143 aa  196  1e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  66.91 
 
 
143 aa  196  1e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  65.94 
 
 
141 aa  194  4e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  66.19 
 
 
143 aa  194  4e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  65.94 
 
 
142 aa  193  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  67.14 
 
 
143 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 
144 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  63.31 
 
 
144 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
141 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  63.77 
 
 
148 aa  184  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  65 
 
 
166 aa  184  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  57.45 
 
 
142 aa  162  1e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 
182 aa  151  3e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  57.46 
 
 
162 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  52.52 
 
 
136 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  51.75 
 
 
147 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 
172 aa  143  7e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  55.97 
 
 
167 aa  143  8e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  56.45 
 
 
132 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  53.52 
 
 
141 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  53.24 
 
 
137 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 
155 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  48.92 
 
 
155 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  48.95 
 
 
155 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  50.38 
 
 
147 aa  119  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  119  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  119  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  119  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  117  4e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  3.81021e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  50.38 
 
 
147 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  48.87 
 
 
145 aa  113  8e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 
160 aa  112  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  48.12 
 
 
146 aa  112  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  47.76 
 
 
147 aa  111  4e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.29058e-06  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 
156 aa  110  8e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  48.06 
 
 
147 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  43.94 
 
 
160 aa  109  1e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  48.8 
 
 
153 aa  109  1e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
150 aa  109  1e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
158 aa  108  2e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 
148 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
146 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
168 aa  107  4e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  44.7 
 
 
155 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
158 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
152 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  45.45 
 
 
144 aa  107  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  45.31 
 
 
158 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 
153 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  45.74 
 
 
145 aa  107  7e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  45.52 
 
 
154 aa  107  7e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  44.7 
 
 
155 aa  107  7e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 
153 aa  107  8e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  44.6 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  45.74 
 
 
145 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
154 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
153 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  43.88 
 
 
156 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
160 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  49.22 
 
 
161 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
154 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  45.07 
 
 
159 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 
156 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
154 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  43.94 
 
 
155 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
153 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
153 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  44.7 
 
 
137 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  44.7 
 
 
137 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 
156 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 
156 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  45.97 
 
 
136 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
150 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
159 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  44.09 
 
 
149 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.98 
 
 
145 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  43.65 
 
 
157 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
176 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>