More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0003 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  96.26 
 
 
401 aa  798  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  83.16 
 
 
393 aa  681  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
400 aa  826  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  86.58 
 
 
381 aa  686  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  69.31 
 
 
387 aa  563  1e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  65.97 
 
 
409 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  66.93 
 
 
385 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  64.11 
 
 
404 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  62.83 
 
 
385 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  63.23 
 
 
386 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  61.54 
 
 
385 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  62.17 
 
 
386 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.42 
 
 
405 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.94 
 
 
392 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  60.42 
 
 
385 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  60.37 
 
 
390 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.63 
 
 
398 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  57.95 
 
 
392 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  60.95 
 
 
386 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.69 
 
 
398 aa  469  1e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.99 
 
 
387 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.4 
 
 
389 aa  461  1e-128  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.21 
 
 
391 aa  458  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.72 
 
 
399 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.12 
 
 
402 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.29 
 
 
385 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
385 aa  406  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  54.76 
 
 
385 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  54.17 
 
 
387 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
385 aa  400  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  53.32 
 
 
384 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  52.79 
 
 
385 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  53.4 
 
 
397 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  52.24 
 
 
382 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  51.02 
 
 
393 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  51.8 
 
 
394 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
414 aa  362  7e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 
384 aa  358  1e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 
381 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.72 
 
 
387 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
389 aa  292  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.58 
 
 
390 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 
392 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 
394 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 
393 aa  255  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  37.47 
 
 
417 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  39.28 
 
 
422 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.77 
 
 
416 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.79 
 
 
394 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
381 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.67402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.21 
 
 
383 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 
424 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 
396 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  39.66 
 
 
385 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
383 aa  246  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  37.6 
 
 
390 aa  244  1e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 
379 aa  244  2e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 
390 aa  244  2e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 
419 aa  244  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  39.94 
 
 
422 aa  243  4e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
383 aa  243  4e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 
419 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
386 aa  242  8e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.18 
 
 
385 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
404 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  39.18 
 
 
385 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
386 aa  242  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 
391 aa  240  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  38.76 
 
 
408 aa  239  6e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  35.44 
 
 
409 aa  239  6e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  36.52 
 
 
399 aa  239  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.16 
 
 
380 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  37.68 
 
 
413 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 
401 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  35.19 
 
 
409 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  37.05 
 
 
392 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 
391 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
404 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
404 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
404 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  37.46 
 
 
404 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
404 aa  236  5e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
389 aa  236  5e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  37.35 
 
 
408 aa  236  5e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
404 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
405 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
405 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
405 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
405 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 
404 aa  235  1e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.89 
 
 
387 aa  235  1e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 
381 aa  235  1e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.35 
 
 
414 aa  235  1e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
405 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 
407 aa  235  1e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  36.49 
 
 
405 aa  234  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  36.49 
 
 
405 aa  234  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  37.2 
 
 
380 aa  234  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 
376 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 
378 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>