More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6525 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.6 
 
 
286 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 
279 aa  305  7e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
315 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
298 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 
308 aa  225  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
293 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
311 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
293 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
299 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  41.3 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
287 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
298 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
299 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
300 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
320 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
316 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.13 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  36.17 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  37.09 
 
 
328 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
316 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
295 aa  178  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
316 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
335 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
299 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
328 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  35.02 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  36.49 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0841  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.28 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
323 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
328 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
311 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
294 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
302 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
316 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  34.16 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
334 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
324 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.35 
 
 
314 aa  165  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.738302  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  33.22 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380307  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
331 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
328 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
303 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.41 
 
 
310 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  35.38 
 
 
311 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
303 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.61 
 
 
307 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
307 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
311 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
313 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
308 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
316 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
327 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
309 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.3 
 
 
320 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  33.58 
 
 
321 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
320 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.85 
 
 
318 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
353 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.04 
 
 
318 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
306 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.1 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.33 
 
 
321 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0550121  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
309 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
311 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
338 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.12 
 
 
314 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  34.12 
 
 
314 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
317 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0473972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
305 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
318 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
303 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
296 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
315 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
301 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
312 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
306 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
309 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
314 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
317 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
309 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
314 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>