More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6440 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  65.27 
 
 
263 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  63.16 
 
 
267 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  63.88 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.39 
 
 
264 aa  345  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 
267 aa  341  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  58.56 
 
 
288 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  58.17 
 
 
267 aa  334  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  60 
 
 
272 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  60.31 
 
 
268 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  58.94 
 
 
276 aa  319  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 
269 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  55.89 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  52.29 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 
274 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  55.51 
 
 
274 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  53.03 
 
 
270 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 
266 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 
266 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 
266 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  48.48 
 
 
269 aa  289  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 
273 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  50 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  46.54 
 
 
268 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 
287 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
267 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  47.33 
 
 
245 aa  245  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 
281 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
270 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.25 
 
 
273 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
387 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.24 
 
 
387 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
283 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.56 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
273 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.76 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.38 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.78 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.38 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.41 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.26 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25.41 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.82 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  25.98 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.64 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.8 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  24.71 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  25.5 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.59 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  24.63 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  23.88 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>