More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6436 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 432 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  84.11 
 
 		 432 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  46.91 
 
 		 451 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  49.12 
 
 		 475 aa  349  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  46.55 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  45.89 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  39.3 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  45.4 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  44.55 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  46.47 
 
 		 435 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  33.72 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  39.86 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.73 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  35.14 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.48 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  34.48 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.48 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.48 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  34.48 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  34.48 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  33.33 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  34.31 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  30.16 
 
 		 441 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  34.08 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  35.88 
 
 		 842 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  38.51 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 462 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  31.05 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.92 
 
 		 291 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.72 
 
 		 806 aa  153  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  35.33 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 840 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 862 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  30.63 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  34.46 
 
 		 298 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 1110 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 637 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 807 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 981 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.5 
 
 		 816 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  38.69 
 
 		 752 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 832 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 636 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 636 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.34 
 
 		 1144 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 1235 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 795 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 843 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 864 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 844 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 685 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 859 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1107 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  29.57 
 
 		 1080 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2215  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.33 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0212215  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.98 
 
 		 753 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 833 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 1067 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1108 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1108 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1108 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1108 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1108 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.37 
 
 		 1067 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>