More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6419 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  97.39 
 
 
345 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
345 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  75.36 
 
 
341 aa  554  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  66.76 
 
 
345 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  55.52 
 
 
350 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  58.26 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  55.46 
 
 
342 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  54.28 
 
 
333 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 
341 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  51.03 
 
 
337 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  52.51 
 
 
339 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  50.29 
 
 
341 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  48.08 
 
 
328 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  47.67 
 
 
387 aa  328  9e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  48.09 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  45.45 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  44.68 
 
 
340 aa  295  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  45.32 
 
 
363 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  44.81 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  43.07 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
351 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 
345 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
344 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 
315 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
317 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
517 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  33.43 
 
 
517 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  29.19 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.75 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
343 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
343 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  33.85 
 
 
330 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  28.53 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 
326 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
332 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
318 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 
318 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.75 
 
 
317 aa  152  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 
311 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
315 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.28 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.01 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
360 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.88 
 
 
310 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
355 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
363 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.59 
 
 
310 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.96 
 
 
346 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
347 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
359 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
327 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
311 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  27.59 
 
 
327 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  28.34 
 
 
649 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.39 
 
 
345 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.13 
 
 
354 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
344 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.3 
 
 
353 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 
329 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  27.52 
 
 
320 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  27.52 
 
 
320 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  28.27 
 
 
356 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  27.81 
 
 
313 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.31 
 
 
317 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
310 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  26.53 
 
 
334 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.36 
 
 
319 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  24.77 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
338 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.66 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.02 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.49 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
331 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  25.93 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.4 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  27.49 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.71 
 
 
319 aa  92.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
365 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
334 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
344 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.89 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>