135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6402 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  87.68 
 
 		 141 aa  235  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  51.45 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  51.45 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  51.45 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  50.74 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  51.82 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  50.72 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  49.28 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  52.55 
 
 		 150 aa  137  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  50.37 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  51.09 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  47.86 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  48.89 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  44.93 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  46.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  47.83 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  40 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  38.57 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  42.86 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  42.03 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  37.32 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  37.93 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  38.3 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  36.62 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  37.86 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  38.03 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  36.88 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  37.59 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  38.73 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  37.06 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  37.06 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  37.06 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  37.67 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  36.62 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  37.76 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  33.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  36.17 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  36.88 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  34.53 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  36.55 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  34.93 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  33.56 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  34.25 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  35.42 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  34.93 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  34.72 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  34.25 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  34.27 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  37.84 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  37.84 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  33.78 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  34.93 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  32.64 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  32.64 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  34.93 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  35.17 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  31.97 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  31.72 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  35.62 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  32.64 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  35.92 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  33.1 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  35.46 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  33.83 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  35.37 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  34.27 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  34.25 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  32.19 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  32.87 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  32.62 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  31.47 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  29.29 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  43.53 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  33.8 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>