More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6294 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 387 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.47 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 373 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.72 
 
 		 414 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.73 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.39 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.91 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.38 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  28.12 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.12 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.06 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.46 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.46 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.46 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  30.68 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.34 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  31.83 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.19 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.26 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.12 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.34 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  31.62 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.31 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  29.92 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.26 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.27 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  28.57 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.61 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 413 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3445  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.75 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473565  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.31 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.99 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  27.08 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.85 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.92 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>