96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6244 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  100 
 
 
334 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  87.77 
 
 
327 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  65.5 
 
 
342 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  44.97 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.72 
 
 
339 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.1 
 
 
339 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  40.6 
 
 
340 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40 
 
 
345 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40 
 
 
317 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.94 
 
 
343 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.56 
 
 
337 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  39.7 
 
 
341 aa  235  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.63 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  39.38 
 
 
341 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.09 
 
 
350 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.39 
 
 
350 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  39.13 
 
 
343 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  39.13 
 
 
343 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  39.13 
 
 
343 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  39.55 
 
 
338 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.51 
 
 
350 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  39.31 
 
 
351 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  39.44 
 
 
341 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.58 
 
 
339 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.51 
 
 
366 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  38.46 
 
 
340 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  40.94 
 
 
347 aa  225  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  39.14 
 
 
351 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.67 
 
 
333 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.07 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.22 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  38.79 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.79 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.67 
 
 
343 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.1 
 
 
335 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.1 
 
 
335 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.29 
 
 
343 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  37.74 
 
 
351 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.5 
 
 
330 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.5 
 
 
330 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.08 
 
 
334 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37.17 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  36.51 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  35.56 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.29 
 
 
339 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  38.83 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  40.26 
 
 
362 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  36.39 
 
 
342 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  36.39 
 
 
342 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.58 
 
 
338 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  36.62 
 
 
342 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.81 
 
 
334 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.22 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.22 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.54 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.22 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  32.79 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.88 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.69 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.34 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.25 
 
 
306 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.43 
 
 
119 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.54 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  27.83 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  23.56 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  23.56 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2423  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  23.37 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0751  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.6 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.44 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4154  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.94 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3229  periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein, putative  24.15 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.32 
 
 
355 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2209  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.66 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  22.12 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.59 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.1 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40070  periplasmic sulfonate-binding protein of ABC transporter  26.47 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  24.01 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  24.1 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.43 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.72 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  24.01 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1383  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.46 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0150888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3410  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.91 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0232  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.98 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2306  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.61 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3719  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.91 
 
 
320 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.0719677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
340 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3507  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.4 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>