More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5972 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.29 
 
 
332 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.155681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
332 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66552  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.42 
 
 
332 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3929  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  76.81 
 
 
332 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.62 
 
 
341 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0256159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14290  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  51.99 
 
 
329 aa  359  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.73 
 
 
341 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
327 aa  352  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000370081  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5699  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  50.61 
 
 
327 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0252968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.66 
 
 
338 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285608  normal  0.325568 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.3 
 
 
330 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.74 
 
 
327 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000273599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.74 
 
 
327 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0910485  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.15 
 
 
333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
328 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290712 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 
328 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687314  normal  0.260687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.13 
 
 
328 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00209232  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.82 
 
 
342 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.400561 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 
328 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.0366433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5516  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  48.47 
 
 
328 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 
327 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
322 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.161485  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
328 aa  268  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.111848  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
327 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.772391  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
328 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2949  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
327 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
322 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6876  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
335 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0537311  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
335 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
323 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
337 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5118  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide )  37.91 
 
 
337 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
326 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00111488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
321 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
332 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 
326 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
321 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
321 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
321 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  33.54 
 
 
318 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.54 
 
 
318 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
318 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  33.44 
 
 
307 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
307 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
319 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 
333 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 
318 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
320 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  32.12 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
322 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
334 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
320 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
318 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
321 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.83 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  32.62 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0776  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.42 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429836  hitchhiker  0.000000000000473305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
321 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
319 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
319 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.94 
 
 
348 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
307 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
331 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
319 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
321 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
322 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
324 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
313 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
322 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  31.38 
 
 
313 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
326 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
345 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
326 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  33.24 
 
 
324 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
315 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
322 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
328 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00108438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0726  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0625  oligopeptide ABC transporter permease  30.79 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0895389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0568  oligopeptide ABC transporter, permease  30.49 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0715  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000364541 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0658  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.79 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.975917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>