67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5863 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  72.33 
 
 		 159 aa  247  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  72.33 
 
 		 159 aa  245  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  70.44 
 
 		 159 aa  236  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  49.36 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  47.53 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  47.53 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  57.81 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  47.1 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  50.79 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  53.38 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  47.22 
 
 		 272 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  47.86 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  47.47 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  43.75 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  46.56 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  47.66 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  42.14 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  43.14 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  47.44 
 
 		 171 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  42.41 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  42.54 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  42.42 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  43.75 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  38.56 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  38.85 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  42.19 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  38.85 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  45.45 
 
 		 181 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  40.62 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  36.88 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  40.46 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  35.44 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  36.81 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  36.16 
 
 		 177 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  34.59 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  31.69 
 
 		 182 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  31.32 
 
 		 205 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  33.12 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  30.51 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  31.41 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  31.13 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  30.81 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  28.19 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  29.73 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  29.19 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  35.77 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  32.5 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  31.67 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  26.11 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  26.06 
 
 		 534 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  28.45 
 
 		 314 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  28.35 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  26.42 
 
 		 505 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  39.22 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  28 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  29.27 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.07 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1935  hypothetical protein  26.47 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.187916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  29.13 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  25 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>