More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5789 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5789  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.04167 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6692  transcriptional regulator, LysR family  83.22 
 
 		 300 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363849  normal  0.247449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3325  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.642488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5074  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1574  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0094  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0079  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00400  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0094  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000160709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1856  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2120  LysR family regulatory protein  36.79 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0027  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302128  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0698  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 343 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0483  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0994  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1967  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0840  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7696  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0752  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0033  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195958  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0097  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0065  LysR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0164  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0030  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.65 
 
 		 316 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1006  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3291  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0745  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7408  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4366  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6153  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5634  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5999  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3977  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459808  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2331  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0724376  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0529  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 347 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.438898  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1094  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5486  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1086  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.157723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2717  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.624024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2193  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5901  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00437173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2176  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0722015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0994  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2092  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.95 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3957  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3143  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2571  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2712  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.4 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2901  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.58 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2215  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.57 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0431  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6858  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.32 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3294  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228779  normal  0.107887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0921  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4846  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.067999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0664  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5586  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.861314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  28.36 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4952  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.885595  normal  0.690392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2113  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.84 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0613  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0634  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3219  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2694  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4486  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.978726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4992  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2352  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3743  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00613556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4620  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.68 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1246  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5290  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4028  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5525  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.485988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1692  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5904  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.64 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3805  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.11 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000401969  unclonable  0.0000000245083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.64 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.1 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.74 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>