279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5608 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  93.68 
 
 		 427 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  55.22 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  50.83 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  44.62 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.49 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.87 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.67 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.6 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.51 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.63 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.74 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.34 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.54 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  21.43 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  21.43 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.33 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  24.68 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.22 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.24 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.7 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.5 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  25.36 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.7 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.33 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  24.47 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>