More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5605 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  100 
 
 
325 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  93.23 
 
 
325 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  66.36 
 
 
334 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  63.69 
 
 
332 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  63.08 
 
 
336 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  62.77 
 
 
332 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  62.15 
 
 
332 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  62.15 
 
 
333 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  62.46 
 
 
333 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  62.46 
 
 
334 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  61.23 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  61.35 
 
 
342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  62.46 
 
 
336 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  60.92 
 
 
332 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.66 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  60.62 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  60 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  59.69 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  59.08 
 
 
332 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.35 
 
 
333 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  60.74 
 
 
333 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 
335 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  60.65 
 
 
338 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  60.31 
 
 
332 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  59.69 
 
 
332 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  58.59 
 
 
341 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.38 
 
 
333 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  59.51 
 
 
334 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  57.67 
 
 
342 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  59.2 
 
 
334 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  59.82 
 
 
333 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  61.61 
 
 
332 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  58.46 
 
 
333 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.77 
 
 
333 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.26 
 
 
365 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  59.08 
 
 
344 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  57.98 
 
 
334 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  55.52 
 
 
381 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  57.67 
 
 
333 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  57.1 
 
 
381 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  58.61 
 
 
351 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  59.42 
 
 
359 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  56.36 
 
 
338 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  59.15 
 
 
380 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  59.09 
 
 
376 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  57.93 
 
 
365 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  61.49 
 
 
330 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  56.19 
 
 
369 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  69.73 
 
 
357 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  55.43 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.29 
 
 
372 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54 
 
 
370 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
395 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  56.21 
 
 
358 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  55.49 
 
 
367 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.85 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.43 
 
 
353 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
370 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.56 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  55.3 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.37 
 
 
364 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  56.16 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  57.23 
 
 
361 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 
361 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.67 
 
 
373 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  68.83 
 
 
364 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  56.46 
 
 
359 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  57.54 
 
 
331 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  55.76 
 
 
351 aa  352  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  51.19 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  58.73 
 
 
375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54 
 
 
370 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  55.88 
 
 
362 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  57.23 
 
 
361 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  53.39 
 
 
363 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  54.55 
 
 
368 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  57.63 
 
 
377 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  55.99 
 
 
352 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  54.89 
 
 
374 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  56.44 
 
 
362 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  55.56 
 
 
359 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.03 
 
 
379 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  56.13 
 
 
345 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 
369 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 
357 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 
369 aa  349  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.39 
 
 
349 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 
369 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  57.73 
 
 
362 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  58.1 
 
 
364 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  53.87 
 
 
360 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
378 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  54.2 
 
 
352 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  54 
 
 
366 aa  348  8e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.51 
 
 
349 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
371 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.15 
 
 
355 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  53.85 
 
 
369 aa  347  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>