More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5580 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  463  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  92.64 
 
 		 230 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  77.49 
 
 		 231 aa  360  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  72.48 
 
 		 230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  42.6 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  41.44 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  40.15 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  38.41 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.92 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3403  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  35.62 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  50.59 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>