More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5436 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 959 aa  1904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 		 954 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 		 967 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 973 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  32.01 
 
 		 900 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 1084 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 992 aa  267  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 1013 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 999 aa  201  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 981 aa  165  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 983 aa  160  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 1005 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.27 
 
 		 916 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 993 aa  141  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.03 
 
 		 1006 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 953 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 967 aa  137  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.36 
 
 		 1081 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.69 
 
 		 1034 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.28 
 
 		 1080 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 		 1105 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 1022 aa  111  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.91 
 
 		 977 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.82 
 
 		 1227 aa  106  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 1377 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.66 
 
 		 1123 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.75 
 
 		 1134 aa  101  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.22 
 
 		 1148 aa  101  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  28.42 
 
 		 964 aa  99.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 1311 aa  99  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 		 1139 aa  98.6  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 966 aa  98.6  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  27.65 
 
 		 862 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.86 
 
 		 1175 aa  96.3  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 1118 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.78 
 
 		 1054 aa  94.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 1007 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 1015 aa  91.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  24.95 
 
 		 1151 aa  91.3  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  29.55 
 
 		 884 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 		 1398 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.12 
 
 		 1141 aa  89  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.67 
 
 		 713 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.9 
 
 		 1118 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  31.49 
 
 		 937 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 1138 aa  88.2  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 1116 aa  88.2  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.95 
 
 		 1151 aa  87.8  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 965 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 723 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 956 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.64 
 
 		 957 aa  87  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  27.6 
 
 		 1118 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.6 
 
 		 1118 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.52 
 
 		 1422 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 		 1160 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.93 
 
 		 1150 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.75 
 
 		 1029 aa  85.1  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.62 
 
 		 1149 aa  85.1  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  25.81 
 
 		 1885 aa  84.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  26.32 
 
 		 1123 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 1020 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.39 
 
 		 1093 aa  84.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.7 
 
 		 1133 aa  84  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 1403 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.66 
 
 		 2279 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 1198 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.81 
 
 		 1075 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 1051 aa  81.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.03 
 
 		 1014 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 		 1429 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.81 
 
 		 1441 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.76 
 
 		 1780 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.12 
 
 		 1109 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.99 
 
 		 1183 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.74 
 
 		 1089 aa  79.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.51 
 
 		 1809 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 1192 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.18 
 
 		 1050 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.18 
 
 		 1050 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 		 1048 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.84 
 
 		 1121 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.38 
 
 		 1833 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.61 
 
 		 1065 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.92 
 
 		 892 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 		 1063 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.59 
 
 		 1013 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 1188 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 970 aa  76.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.29 
 
 		 1132 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.64 
 
 		 1055 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 1046 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  26.43 
 
 		 914 aa  75.5  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>