295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5423 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  89.67 
 
 
242 aa  451  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.9 
 
 
242 aa  271  5e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  51.69 
 
 
245 aa  238  7e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.84 
 
 
266 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.44 
 
 
837 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.02 
 
 
283 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.26 
 
 
257 aa  214  1e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.52 
 
 
246 aa  212  4e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.11 
 
 
246 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.2 
 
 
279 aa  199  4e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.72 
 
 
808 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38 
 
 
249 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.2 
 
 
249 aa  147  1e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.19 
 
 
260 aa  147  1e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.42 
 
 
246 aa  127  1e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 
261 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 
244 aa  125  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 
261 aa  125  8e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.32 
 
 
228 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.5 
 
 
282 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
236 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
233 aa  119  5e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.68 
 
 
232 aa  117  1e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.82 
 
 
226 aa  117  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.16 
 
 
250 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.11 
 
 
271 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.07 
 
 
287 aa  112  7e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 
265 aa  112  7e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
258 aa  111  1e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
243 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
264 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 
278 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.08 
 
 
285 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
281 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
255 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.89 
 
 
273 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
278 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.25 
 
 
285 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
231 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
247 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 
285 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  34.73 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.52 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  30.83 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 
271 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.48 
 
 
299 aa  92.4  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 
282 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.38 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
673 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
269 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.69 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.69 
 
 
338 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.66 
 
 
298 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  34.87 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.69 
 
 
1153 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
257 aa  82.8  4e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 
265 aa  82.8  4e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
260 aa  82.8  5e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  30.35 
 
 
657 aa  81.3  1e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 
240 aa  80.9  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 
251 aa  79  6e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 
644 aa  79  6e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  26.48 
 
 
302 aa  79  6e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 
257 aa  78.6  9e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
289 aa  78.6  9e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 
236 aa  77.8  1e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  29.29 
 
 
639 aa  77.4  2e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
639 aa  77.8  2e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  32.65 
 
 
240 aa  77  3e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 
240 aa  77  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
300 aa  76.3  4e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.55 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.55 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.55 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.55 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.55 
 
 
252 aa  76.3  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
248 aa  75.9  6e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>