More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5420 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  83.2 
 
 
502 aa  855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  81.25 
 
 
507 aa  840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
516 aa  1033    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.14 
 
 
510 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1982  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.2 
 
 
262 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  73.14 
 
 
260 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  61.67 
 
 
243 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  61.76 
 
 
247 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  61.34 
 
 
247 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  61.34 
 
 
247 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.5 
 
 
598 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  60.49 
 
 
245 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.07 
 
 
598 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
595 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.36 
 
 
591 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  63.36 
 
 
591 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.36 
 
 
591 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2483  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.96 
 
 
254 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000249408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  60.42 
 
 
243 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  58.92 
 
 
249 aa  292  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6339  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.73 
 
 
265 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.99 
 
 
602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.18 
 
 
619 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 
592 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 
506 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
595 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
597 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  39.08 
 
 
597 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 
597 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.01 
 
 
500 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
581 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.7 
 
 
582 aa  281  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
567 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 
594 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.19 
 
 
594 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
598 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.65 
 
 
240 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
242 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
500 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.23 
 
 
240 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.88 
 
 
242 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.07 
 
 
244 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.59 
 
 
567 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.81 
 
 
246 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.3 
 
 
242 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  56.3 
 
 
256 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.3 
 
 
242 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
251 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  54.43 
 
 
255 aa  267  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
240 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.2 
 
 
244 aa  266  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.65 
 
 
243 aa  266  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  53.75 
 
 
269 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
258 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
510 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  51.19 
 
 
258 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  51.19 
 
 
258 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  52.92 
 
 
257 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.97 
 
 
256 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 
240 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  52.92 
 
 
257 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.78 
 
 
249 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.19 
 
 
246 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 
269 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.7 
 
 
240 aa  263  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.44 
 
 
249 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  57.55 
 
 
265 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 
559 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  56.78 
 
 
243 aa  262  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.65 
 
 
243 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
241 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 
268 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  51.44 
 
 
249 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.14 
 
 
247 aa  260  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  54.51 
 
 
257 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 
241 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
257 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
249 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.22 
 
 
510 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.97 
 
 
244 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  57.44 
 
 
245 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
253 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.13 
 
 
244 aa  259  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.72 
 
 
246 aa  259  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.91 
 
 
242 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.62 
 
 
244 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  54.2 
 
 
289 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  56.7 
 
 
243 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.3 
 
 
240 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
263 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  52.85 
 
 
255 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  54.66 
 
 
252 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.44 
 
 
289 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  54.27 
 
 
255 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>