258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5409 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  96.61 
 
 
236 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  70.76 
 
 
241 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  70.34 
 
 
236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  69.83 
 
 
238 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  68.22 
 
 
238 aa  339  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  68.64 
 
 
236 aa  334  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  67.37 
 
 
239 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  66.95 
 
 
241 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  66.53 
 
 
241 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  67.37 
 
 
239 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  65.25 
 
 
241 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  66.53 
 
 
237 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  64.41 
 
 
241 aa  317  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  65.25 
 
 
239 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  59.03 
 
 
252 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  49.34 
 
 
244 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.69 
 
 
240 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  47.64 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  40.72 
 
 
505 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  39.37 
 
 
489 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  42.4 
 
 
545 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  39.01 
 
 
240 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  40.47 
 
 
239 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  37.84 
 
 
509 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  37.84 
 
 
509 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  37.84 
 
 
529 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  36.44 
 
 
237 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  35.59 
 
 
237 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  37.27 
 
 
234 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  39.38 
 
 
238 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  37.93 
 
 
232 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  36.21 
 
 
237 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  38.26 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  38.26 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  34.53 
 
 
232 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  35.78 
 
 
532 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  37.93 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  39.3 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  39.5 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  36.84 
 
 
237 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  36.92 
 
 
236 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  35.19 
 
 
247 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  36.92 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  36.09 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  34.33 
 
 
248 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  33.9 
 
 
275 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  36.93 
 
 
258 aa  121  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  40.09 
 
 
508 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  34.82 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.14 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  30.05 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  30.5 
 
 
281 aa  82  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  31.4 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  29.05 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  30.2 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  30.73 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.5 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.5 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.7 
 
 
615 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  26.94 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.36 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.74 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  25.24 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.05 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  29.3 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  32.7 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  28.3 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.54 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.73 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  26.96 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.88 
 
 
216 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.51 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.06 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.4 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.95 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.55 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.73 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.56 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.73 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  29.58 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  31.19 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.34 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3793  demethylmenaquinone methyltransferase-like protein  27.88 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.62 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.1 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  33.83 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.65 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  27.91 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  29.35 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.08 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  28.64 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.58 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.84 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>