More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5384 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  57.85 
 
 
738 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  54.27 
 
 
728 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.27 
 
 
728 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.79 
 
 
731 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  45.77 
 
 
754 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  59.7 
 
 
736 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 
759 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  54.03 
 
 
740 aa  778    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  61.38 
 
 
775 aa  892    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.87 
 
 
721 aa  808    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  54.41 
 
 
728 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  50.76 
 
 
746 aa  747    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.47 
 
 
741 aa  882    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.59 
 
 
729 aa  850    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.44 
 
 
634 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  50.49 
 
 
745 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  50.84 
 
 
729 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  52.23 
 
 
765 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  59.33 
 
 
741 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  54.03 
 
 
621 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  51.94 
 
 
749 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 
755 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  60.85 
 
 
750 aa  874    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  57.46 
 
 
728 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  53.52 
 
 
740 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  53.39 
 
 
716 aa  749    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  54.57 
 
 
748 aa  760    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  47.68 
 
 
764 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  57.85 
 
 
738 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.32 
 
 
749 aa  759    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  59.94 
 
 
743 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.31 
 
 
737 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  57.46 
 
 
728 aa  805    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  56.71 
 
 
735 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  49.05 
 
 
764 aa  707    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  48.92 
 
 
765 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 
731 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  51.92 
 
 
638 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.91 
 
 
726 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  59.75 
 
 
712 aa  846    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  46.19 
 
 
754 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  48.79 
 
 
774 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  51.64 
 
 
746 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  54.05 
 
 
725 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  53.13 
 
 
736 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  49.66 
 
 
743 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.56 
 
 
740 aa  800    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  45.91 
 
 
754 aa  677    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  53.01 
 
 
834 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  51.33 
 
 
642 aa  640    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  52.33 
 
 
812 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  53.13 
 
 
716 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  53.31 
 
 
721 aa  723    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  54.13 
 
 
638 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  53.22 
 
 
625 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  53.27 
 
 
729 aa  782    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 
756 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  52.34 
 
 
716 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  51.82 
 
 
725 aa  710    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  60.06 
 
 
736 aa  864    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 
716 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  54.19 
 
 
716 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 
755 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.05 
 
 
732 aa  711    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  58.09 
 
 
736 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  49.24 
 
 
759 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  56.43 
 
 
722 aa  823    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  49.86 
 
 
729 aa  707    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  57.44 
 
 
738 aa  823    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  47.81 
 
 
763 aa  718    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.51 
 
 
738 aa  808    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  56.94 
 
 
728 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  59.29 
 
 
736 aa  889    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  59.67 
 
 
732 aa  841    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 
712 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.71 
 
 
807 aa  776    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 
776 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  50.63 
 
 
745 aa  741    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  50.76 
 
 
745 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  54.49 
 
 
695 aa  723    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  47.35 
 
 
744 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  58.25 
 
 
733 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  59.67 
 
 
732 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  46.05 
 
 
754 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 
1224 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  58.09 
 
 
736 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  54.14 
 
 
642 aa  698    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.42 
 
 
723 aa  735    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 
728 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  50.63 
 
 
745 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.02 
 
 
727 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  49.52 
 
 
741 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  54.27 
 
 
731 aa  771    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  49.86 
 
 
749 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.06 
 
 
841 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  49.24 
 
 
759 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  46.66 
 
 
771 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  49.79 
 
 
737 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.35 
 
 
631 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 
640 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>