206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5242 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  70.5 
 
 		 200 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  49.23 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  47.74 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  50 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  51.27 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  50.5 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 874 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  46.5 
 
 		 877 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  35.6 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  30.16 
 
 		 974 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  30.16 
 
 		 962 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  30.16 
 
 		 950 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  26.5 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  27.46 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  31.41 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  29.47 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  25.89 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  25.97 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  25.25 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  24.6 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  27.13 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  29.59 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  26.15 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  24.32 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  25 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  22.09 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  30.15 
 
 		 882 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  24.12 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  25.14 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  26.88 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  25.13 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  24 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  28.36 
 
 		 879 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  28.36 
 
 		 879 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  29.63 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  27.21 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  32.59 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  22.95 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  26.35 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  25.13 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  25.43 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  26.35 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  26.35 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  25.17 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  26.35 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  25.26 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  26.87 
 
 		 293 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  30.19 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  29.65 
 
 		 879 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  28.89 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  28.89 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  28.3 
 
 		 273 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 		 293 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  27.36 
 
 		 284 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  29.81 
 
 		 284 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  29.81 
 
 		 284 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  31.85 
 
 		 284 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  24.14 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  21.76 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 		 285 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  24.14 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  26.16 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.99 
 
 		 293 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  30.37 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  30.37 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  30.3 
 
 		 284 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  25.37 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  29.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  22.8 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  25.43 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  28.68 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  28.15 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  24.5 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  31.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  27.88 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  27.88 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  32.17 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  21.86 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  29 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  27.36 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  25.99 
 
 		 796 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  29.75 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  25.41 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  32.59 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>