More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5076 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 472 aa  961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.18 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  47.88 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 490 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.3 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.83 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4754  GntR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 365 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 509 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 509 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 495 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 504 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.91 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 494 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.35 
 
 		 488 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 485 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.99 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 485 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 517 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.84 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.03 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.2 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.09 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.42 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 501 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.44 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 503 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.05 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 506 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.97 
 
 		 497 aa  266  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 569 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.4 
 
 		 495 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.4 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 502 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 507 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.4 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 488 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  40.56 
 
 		 570 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 498 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.5 
 
 		 494 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 523 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  34.37 
 
 		 520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>