More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5012 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  100 
 
 		 407 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  64.77 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  63.43 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  54.33 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  50.38 
 
 		 395 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  44.3 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  48.59 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  45.72 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  42.05 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  43.19 
 
 		 388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  45.43 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  41.54 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.05 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  37.95 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  40.43 
 
 		 413 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  38.4 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  35.19 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  34.95 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  33.24 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  33.76 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  28.93 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.03 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  28.68 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.27 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  30.18 
 
 		 896 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.23 
 
 		 885 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  31.3 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  30.33 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.32 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.43 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.47 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.19 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.61 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.83 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.51 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.93 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  27.71 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  28.75 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  28.88 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  29.81 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.85 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.85 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.57 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  29.76 
 
 		 429 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.44 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.01 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.32 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.67 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.68 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.39 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.5 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.21 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  30.59 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.23 
 
 		 878 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  30.98 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.64 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.59 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.81 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.7 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  26.79 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28.54 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.66 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.91 
 
 		 880 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.29 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.25 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.2 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.5 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.33 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.06 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.04 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  30.28 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.02 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.53 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.4 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  30.21 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.49 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.4 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.48 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  28.67 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  29.72 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.71 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.95 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.28 
 
 		 605 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.2 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  26.32 
 
 		 665 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  25.13 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  26.7 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.25 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.68 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  26.95 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>