More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4894 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  92.68 
 
 
369 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
369 aa  752    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  93.5 
 
 
369 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  42.47 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  33.15 
 
 
412 aa  209  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  38.68 
 
 
372 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 
426 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  35.93 
 
 
369 aa  202  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  34.97 
 
 
410 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.97 
 
 
414 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.7 
 
 
415 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.58 
 
 
400 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.52 
 
 
416 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.25 
 
 
453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.43 
 
 
451 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.24 
 
 
434 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
402 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  35.44 
 
 
403 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  36.54 
 
 
401 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  37.43 
 
 
361 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.71 
 
 
370 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.88 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.97 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.53 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.92 
 
 
406 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  36.16 
 
 
414 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  35.08 
 
 
402 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
408 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
402 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
403 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.86 
 
 
406 aa  179  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  35.37 
 
 
379 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.87 
 
 
446 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.61 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.35 
 
 
414 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 
410 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.33 
 
 
420 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  37.18 
 
 
359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.66 
 
 
501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.98 
 
 
417 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  32.92 
 
 
420 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.97 
 
 
411 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 
425 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 
431 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  32.19 
 
 
427 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 
440 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.82 
 
 
407 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 
461 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.56 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  34.38 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 
425 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.72 
 
 
367 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  34.38 
 
 
427 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
457 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.69 
 
 
429 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.86 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.33 
 
 
431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  33.96 
 
 
409 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  34.07 
 
 
428 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.11 
 
 
430 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  34.07 
 
 
428 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  32.59 
 
 
419 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.23 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.85 
 
 
419 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.23 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.46 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  32.28 
 
 
431 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  33.85 
 
 
424 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.07 
 
 
418 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.07 
 
 
418 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.44 
 
 
408 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.13 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.72 
 
 
425 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  32.41 
 
 
437 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.51 
 
 
416 aa  137  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  33.75 
 
 
418 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.44 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.72 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.52 
 
 
414 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 
445 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
465 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  32.82 
 
 
406 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
425 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.61 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.55 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  29.25 
 
 
453 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.61 
 
 
408 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  29.75 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 
409 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  29.45 
 
 
425 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.36 
 
 
437 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
405 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>