More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4857 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 226 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  63.38 
 
 		 222 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  62.91 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  41.67 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  40.69 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  41.67 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  37.44 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  41.29 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 260 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 257 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  33.18 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.37 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.69 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>