153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4755 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  82.65 
 
 
438 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
438 aa  905    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  57.77 
 
 
468 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  60.09 
 
 
439 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  56.84 
 
 
468 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  59.27 
 
 
437 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  59.22 
 
 
441 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  57.21 
 
 
449 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  53.83 
 
 
457 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  53.72 
 
 
456 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  52.82 
 
 
453 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  53.05 
 
 
456 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  51.28 
 
 
474 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  51.69 
 
 
451 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  53.09 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  51.46 
 
 
451 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  51.46 
 
 
451 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  51.46 
 
 
451 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  51.24 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  51.24 
 
 
451 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  52.62 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  50.34 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  48.54 
 
 
446 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  49.44 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  49.44 
 
 
441 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  47.95 
 
 
430 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  47.48 
 
 
430 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  46.12 
 
 
439 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  45.05 
 
 
438 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  43.94 
 
 
435 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  44.59 
 
 
435 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  42.6 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  41.29 
 
 
441 aa  329  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  44.29 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  41.93 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  39.91 
 
 
462 aa  302  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  37.53 
 
 
447 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 
490 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  36.61 
 
 
489 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  35.79 
 
 
490 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  36.38 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  36.1 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
426 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  29.15 
 
 
452 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  30.29 
 
 
463 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  31.32 
 
 
426 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.2 
 
 
475 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  27 
 
 
474 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  28.14 
 
 
460 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  28.57 
 
 
476 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  26.48 
 
 
452 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
466 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  30.24 
 
 
447 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  26.35 
 
 
485 aa  143  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.21 
 
 
441 aa  143  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  28.06 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.57 
 
 
432 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  29.18 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  29.18 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  29.18 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  29.18 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  28.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  28.95 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  28.95 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  29.42 
 
 
441 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.55 
 
 
440 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
436 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  25.93 
 
 
442 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  26.03 
 
 
452 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  25 
 
 
448 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1215  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505434  normal  0.0851438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  26.99 
 
 
450 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 
450 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  28.28 
 
 
451 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  26.74 
 
 
450 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  28.03 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  26.97 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  26.97 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  26.97 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  26.97 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  26.97 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
480 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  27.78 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  27.78 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  27.34 
 
 
451 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>