96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4691 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  86.62 
 
 		 284 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0345  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1076  xylose isomerase domain-containing protein  30.55 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.01 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2792  xylose isomerase domain-containing protein  32.98 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1085  xylose isomerase domain-containing protein  32.98 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.86 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5338  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.3 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218973  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2962  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.17 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1462  xylose isomerase-like  29.54 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0792814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0582  xylose isomerase domain-containing protein  29.58 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101642  normal  0.477879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0991  xylose isomerase domain-containing protein  26.95 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1167  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.64 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2917  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.67 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2948  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0008  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.3 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0249  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.69 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0210  xylose isomerase domain-containing protein  25.31 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0204  xylose isomerase domain-containing protein  25.31 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0086  xylose isomerase domain-containing protein  27.09 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0571  xylose isomerase domain-containing protein  26.35 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1909  xylose isomerase domain-containing protein  26.01 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1812  xylose isomerase domain-containing protein  29.11 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0391  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.17 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2256  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0049  xylose isomerase domain-containing protein  26.03 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2615  xylose isomerase domain-containing protein  26.76 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2764  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.98 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1620  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.48 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2881  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10540  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.51 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2397  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.15 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0393  xylose isomerase-like TIM barrel  25.5 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0897336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.02 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.26961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2880  xylose isomerase domain-containing protein  26.97 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  22.55 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1849  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.98 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3847  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1355  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.49 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4275  normal  0.774655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5396  hypothetical protein  24.38 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0868602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11150  sugar phosphate isomerase/epimerase  25 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.750375  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4061  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.08 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  34.17 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000176809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8255  xylose isomerase domain-containing protein  27.3 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1733  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.24 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4651  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.91 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15580  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.84 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6155  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905747  hitchhiker  0.000288206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3268  xylose isomerase domain-containing protein  24.33 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4917  xylose isomerase domain-containing protein  27.41 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.462134 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6571  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.48 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00340356  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2300  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.08 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4616  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.08 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33700  hypothetical protein  23.31 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  19.85 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4327  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.17 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0966717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3195  xylose isomerase domain-containing protein  23.67 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  23.08 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  21.92 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3195  hydroxypyruvate isomerase  24.54 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568718  normal  0.0120723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.3 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.62 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  25.19 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3831  hypothetical protein  26.72 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0160671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  21.79 
 
 		 515 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.98 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3406  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.85 
 
 		 350 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.63 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.85 
 
 		 350 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  23.38 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 659 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0197966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.75 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0545  hypothetical protein  23.68 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1842  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5223  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.38 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539656  normal  0.643563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  25.51 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0547  hypothetical protein  25.2 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3409  xylose isomerase domain-containing protein  26.05 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.822122  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4767  xylose isomerase domain-containing protein  27.66 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.222121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  28.16 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  39.66 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2826  xylose isomerase-like TIM barrel  23.15 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  22.99 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  24.11 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2788  xylose isomerase domain-containing protein  24.34 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0951209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.77 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  24.68 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>