More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4594 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
294 aa  611  1e-174  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  97.62 
 
 
294 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  56.76 
 
 
339 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  57.65 
 
 
325 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  59.22 
 
 
329 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  58.87 
 
 
329 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  58.87 
 
 
329 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 
329 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 
329 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 
329 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 
329 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  58.51 
 
 
329 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  54.09 
 
 
294 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  57.25 
 
 
328 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  55.83 
 
 
319 aa  320  2e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  55.48 
 
 
319 aa  320  2e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  55.83 
 
 
319 aa  320  2e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  55.83 
 
 
319 aa  320  2e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  55.48 
 
 
319 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  55.48 
 
 
322 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  55.12 
 
 
319 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  53.02 
 
 
296 aa  302  6e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  49.12 
 
 
297 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
330 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
318 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
339 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
332 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
332 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
332 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  50.88 
 
 
350 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  50.88 
 
 
350 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  48.76 
 
 
311 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
312 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
312 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
312 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  53.02 
 
 
256 aa  244  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  40.28 
 
 
301 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  40.28 
 
 
307 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
301 aa  220  2e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
321 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
301 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  39.86 
 
 
315 aa  218  8e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 
299 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  39.44 
 
 
299 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
310 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  36.81 
 
 
301 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.88741e-11  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
301 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  37.91 
 
 
287 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 
309 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
315 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
315 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  37.81 
 
 
301 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  43.4 
 
 
308 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 
303 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 
298 aa  201  1e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  44.03 
 
 
325 aa  200  2e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 
303 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 
326 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 
326 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.69 
 
 
319 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
311 aa  180  3e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.18709e-05  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  33.57 
 
 
296 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 
302 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
309 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
289 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 
289 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 
291 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 
290 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  3.61988e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 
324 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 
324 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 
324 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 
302 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 
301 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
324 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.35 
 
 
289 aa  140  2e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 
291 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 
295 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 
303 aa  139  8e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 
288 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 
286 aa  135  6e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.07 
 
 
289 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
323 aa  135  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 
290 aa  135  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
318 aa  134  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 
327 aa  134  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 
318 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.30517e-05  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
327 aa  132  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.15 
 
 
292 aa  129  4e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.71 
 
 
290 aa  129  4e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
325 aa  128  9e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 
292 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  30.82 
 
 
284 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 
291 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 
281 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 
324 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>