More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4546 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  92.91 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  80.32 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  73.97 
 
 		 244 aa  367  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  68.6 
 
 		 245 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  70.54 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  70.2 
 
 		 256 aa  348  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  66.94 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  66.94 
 
 		 249 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  65.29 
 
 		 247 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  65.84 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  65.7 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  66.26 
 
 		 242 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.16 
 
 		 242 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.4 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.17 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.6 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.8 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.92 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  60.08 
 
 		 255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.4 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.4 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.13 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.34 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.92 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.5 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  58.85 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  58.02 
 
 		 267 aa  298  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.23 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.23 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.67 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.43 
 
 		 246 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  58.26 
 
 		 268 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.26 
 
 		 244 aa  297  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  59.26 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  60.49 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.2 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  59.34 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.26 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.2 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.6 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.15 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.61 
 
 		 246 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.16 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  58.44 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  58.44 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.98 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.72 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.75 
 
 		 249 aa  294  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  60.57 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 247 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.75 
 
 		 269 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  58.78 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.26 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  57.61 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.67 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  58.09 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.85 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  59.26 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 251 aa  291  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  57.49 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  57.6 
 
 		 251 aa  291  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 		 251 aa  291  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  58.26 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  59.76 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  56.97 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  57.6 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.2 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.05 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.2 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.2 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  60.17 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  58.85 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  58.96 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.28 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  58.51 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.45 
 
 		 267 aa  289  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.79 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  57.87 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>