238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4455 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4455  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
417 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0616202  normal  0.0186598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0049  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  58.75 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0270  hypothetical protein  58.63 
 
 
419 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3289  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1838  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0057  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0056  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2714  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.88 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.395305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0612  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.39 
 
 
400 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.915059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2537  hypothetical protein  27.81 
 
 
385 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00283871  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1173  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.42 
 
 
393 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.760963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.73 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1076  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.17 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  38.46 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.75 
 
 
397 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  36.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.43 
 
 
392 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0852  hypothetical protein  44.05 
 
 
451 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  30.8 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  25.94 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  32.8 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  23.17 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.83 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4065  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
399 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.64 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0220  urea ABC transporter, urea binding protein  23.32 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618006  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.33 
 
 
414 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.18 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
397 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  33.94 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.18 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.18 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  32.97 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  35.8 
 
 
447 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  23.12 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  39.74 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  23.33 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  36.11 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.04 
 
 
378 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
383 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.98 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  34.62 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  35.06 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.96 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  21.87 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  23.11 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  28.57 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.84 
 
 
408 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.32 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
381 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
448 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.41 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  22.65 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  33.02 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>