More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4371 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  95.61 
 
 		 228 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  70.61 
 
 		 228 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  63.6 
 
 		 229 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  64.32 
 
 		 249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  65.35 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  61.11 
 
 		 230 aa  284  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  62.28 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  59.66 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  59.23 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.98 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  50.22 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.78 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  48.2 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  48.2 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  49.57 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.46 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  46.22 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  46.22 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  47.09 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  49.34 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  46.7 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  45.81 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  48.02 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  48.23 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  45.29 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.2 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  47.09 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  45.09 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  44.35 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  43.23 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 227 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  46.23 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  44.69 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  44.69 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 278 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  41.81 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  40.52 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  40.95 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  40.95 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>