More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4366 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  67.12 
 
 
527 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.76 
 
 
524 aa  814    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
524 aa  1064    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  97.33 
 
 
524 aa  1038    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  67.12 
 
 
527 aa  705    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  65.63 
 
 
524 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.16 
 
 
529 aa  657    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  80.88 
 
 
527 aa  878    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  67.88 
 
 
527 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.92 
 
 
525 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.77 
 
 
526 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.07 
 
 
524 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.62 
 
 
523 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.64 
 
 
520 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.83 
 
 
521 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.66 
 
 
522 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.64 
 
 
520 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.56 
 
 
518 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.4 
 
 
517 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.93 
 
 
517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.88 
 
 
524 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.09 
 
 
524 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.3 
 
 
525 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.53 
 
 
523 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.57 
 
 
534 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.07 
 
 
520 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.29 
 
 
509 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.28 
 
 
508 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.07 
 
 
511 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.49 
 
 
509 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.23 
 
 
509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  53.23 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.42 
 
 
509 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.99 
 
 
500 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.22 
 
 
514 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.72 
 
 
510 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.99 
 
 
512 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.54 
 
 
519 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.35 
 
 
519 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.59 
 
 
547 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.53 
 
 
476 aa  344  2.9999999999999997e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  40.5 
 
 
542 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.55 
 
 
530 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.87 
 
 
553 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.61 
 
 
558 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.09 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.56 
 
 
480 aa  319  7e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.78 
 
 
506 aa  319  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.64 
 
 
561 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.17 
 
 
556 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.22 
 
 
553 aa  316  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.34 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  37.37 
 
 
544 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.7 
 
 
549 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.18 
 
 
547 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.53 
 
 
557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.5 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.42 
 
 
544 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.15 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.39 
 
 
544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.09 
 
 
527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.61 
 
 
546 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.8 
 
 
522 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.37 
 
 
543 aa  306  8.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.27 
 
 
546 aa  306  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.93 
 
 
544 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  34.93 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.5 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 
546 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.79 
 
 
534 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.09 
 
 
525 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 
546 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 
546 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.86 
 
 
525 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.09 
 
 
525 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 
546 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 
546 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.09 
 
 
525 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.09 
 
 
525 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.09 
 
 
522 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.34 
 
 
521 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.26 
 
 
533 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.88 
 
 
543 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.86 
 
 
525 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.64 
 
 
539 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.2 
 
 
543 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.88 
 
 
540 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.88 
 
 
543 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.47 
 
 
541 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.03 
 
 
549 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.86 
 
 
525 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.88 
 
 
543 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.67 
 
 
540 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.41 
 
 
522 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  37.68 
 
 
541 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.24 
 
 
540 aa  300  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.26 
 
 
533 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.16 
 
 
522 aa  299  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.72 
 
 
546 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.94 
 
 
539 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>