More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4289 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
166 aa  332  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  83.67 
 
 
147 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
169 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
162 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  52.86 
 
 
163 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
189 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
189 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
162 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
151 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.93 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  42.61 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.11 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  44 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  29.29 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  39.25 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
194 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  54.3  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  30.94 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  29.73 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
179 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
172 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  32.09 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  34.04 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
233 aa  51.2  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
168 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  33.63 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>