More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4279 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  93.29 
 
 
328 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
328 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  79.57 
 
 
328 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  76.22 
 
 
328 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  64.94 
 
 
328 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  60.49 
 
 
342 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.93 
 
 
328 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.93 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  46.86 
 
 
322 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  44.38 
 
 
328 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  41.34 
 
 
330 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  42.46 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  40.91 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  42.68 
 
 
329 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  41.77 
 
 
326 aa  242  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  38.3 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  38.75 
 
 
337 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  40.31 
 
 
328 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  36.48 
 
 
330 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
331 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 
336 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 
332 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 
338 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.62 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
325 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
324 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 
667 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
344 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.82 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
365 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
331 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  31.65 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
332 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.28 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.83 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  36.45 
 
 
337 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
667 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
331 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 
323 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.69 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
667 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.96 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  28.87 
 
 
451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  25.6 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
667 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
392 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.83 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
385 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
373 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
321 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.66 
 
 
438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  24.33 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  25.8 
 
 
359 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  34.05 
 
 
328 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
324 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  33.62 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  32.44 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.3 
 
 
670 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  33.62 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  31.92 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  29.55 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
321 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.88 
 
 
327 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
332 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  33.19 
 
 
328 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  33.62 
 
 
334 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  33.62 
 
 
334 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
349 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
345 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
352 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
327 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
332 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  28.33 
 
 
408 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  33.62 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  23.49 
 
 
362 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
435 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
435 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
332 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
329 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
329 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
468 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.62 
 
 
331 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
458 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>