45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4229 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  100 
 
 
405 aa  843  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  30.97 
 
 
394 aa  148  1e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  29.25 
 
 
394 aa  142  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25466e-08 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  28.5 
 
 
400 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  26.08 
 
 
435 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  27.59 
 
 
407 aa  120  4e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  27.23 
 
 
407 aa  119  1e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  28.82 
 
 
431 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  26.95 
 
 
380 aa  114  4e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  26.25 
 
 
429 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  27.33 
 
 
451 aa  110  4e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  25.88 
 
 
438 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  26.5 
 
 
422 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  25.06 
 
 
388 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  39.01 
 
 
465 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  40.62 
 
 
428 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  27.02 
 
 
421 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  24.1 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  24.04 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  39.2 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  25.72 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  27.27 
 
 
456 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  25.93 
 
 
435 aa  93.6  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  25.74 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  24.2 
 
 
432 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  25.68 
 
 
422 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  23.38 
 
 
454 aa  81.3  3e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  33.08 
 
 
459 aa  73.2  7e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  29.3 
 
 
449 aa  67.8  3e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  21.65 
 
 
447 aa  67  6e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  34.04 
 
 
456 aa  65.5  2e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  23.46 
 
 
448 aa  57.4  5e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  27.21 
 
 
458 aa  55.8  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  25 
 
 
445 aa  55.5  2e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.80978e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  23.23 
 
 
448 aa  55.5  2e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.40563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  29.51 
 
 
426 aa  52.8  1e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  29.17 
 
 
437 aa  50.4  6e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  25 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  32.29 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  25 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  39.71 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  33.33 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  28.12 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.12 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>