54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4209 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  100 
 
 
349 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  88.83 
 
 
349 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  51.01 
 
 
363 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  45.81 
 
 
347 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  45.43 
 
 
333 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  44.95 
 
 
376 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  45.07 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  42.22 
 
 
356 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  41.27 
 
 
356 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  45.02 
 
 
635 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 
556 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  44.34 
 
 
709 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  40.66 
 
 
336 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  35.97 
 
 
334 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  37.58 
 
 
326 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
352 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  29.54 
 
 
749 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 
814 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  21.02 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
461 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  29.06 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.34 
 
 
525 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  29.77 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.73 
 
 
900 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  27.09 
 
 
638 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.91 
 
 
584 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  28.29 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.44 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  22.98 
 
 
561 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.18 
 
 
1194 aa  52.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
359 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  27.63 
 
 
399 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 
343 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  24.91 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  24.91 
 
 
523 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  25.37 
 
 
470 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  18.86 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  22.09 
 
 
475 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 
468 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.64 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  21.51 
 
 
421 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  24.32 
 
 
588 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  20.61 
 
 
470 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.22 
 
 
869 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 
443 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 
660 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  23.96 
 
 
457 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
362 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>