71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4088 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  94.97 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  74.42 
 
 		 183 aa  271  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  66.48 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  62.75 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  63.58 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  60.62 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  56.83 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  47.78 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  52.05 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  49.66 
 
 		 183 aa  157  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  42.37 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  47.59 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  46.05 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  45.52 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  39.88 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  45.81 
 
 		 175 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  45.52 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  41.3 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  45.14 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  45.27 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  45.71 
 
 		 137 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  44.16 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  44.16 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  38.04 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  40.14 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  35.17 
 
 		 203 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  35.17 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  37.25 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  37.01 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  36.05 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  37.41 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  32.84 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  30.54 
 
 		 367 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  92  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  28.68 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  28.57 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  32.06 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  31.13 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  29.63 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  29.2 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  32.79 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  27.22 
 
 		 556 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 907 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.75 
 
 		 474 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  26.95 
 
 		 532 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  26.47 
 
 		 532 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 424 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  26.76 
 
 		 536 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  35.38 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.66 
 
 		 616 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.84 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.73 
 
 		 553 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  28.85 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  30.3 
 
 		 236 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2431  SH3, type 3  32.86 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  38.67 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  28.41 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>