More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4055 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  99.28 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  84.67 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  86.82 
 
 		 138 aa  230  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  72.09 
 
 		 136 aa  201  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  67.91 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  67.91 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  67.16 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  68.25 
 
 		 164 aa  183  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  68.25 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  66.93 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  62.12 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  66.13 
 
 		 171 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  62.7 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  69.64 
 
 		 208 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  57.78 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  62.4 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  56.52 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  63.2 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  56.52 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  60.8 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  65.35 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  65.35 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  53.73 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  58.54 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  54.69 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 195 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  58.73 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  55.81 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  54.33 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  53.72 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  52.24 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  51.94 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  51.61 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  51.61 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  50.89 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  41.94 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  45.6 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  36.94 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  36.89 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  32.63 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  30.16 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.58 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.82 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  35.96 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  37.65 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  31.15 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  35.63 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  37.5 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  37.5 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  37.5 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  35.64 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  37.8 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  36.67 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  37.8 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  36.47 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  37.04 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.61 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  34.12 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  38.04 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  31.37 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  34 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  34 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  35.64 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>