71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3960 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1064 aa  2105    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  45.29 
 
 		 1052 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  92.86 
 
 		 1064 aa  1910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  63.6 
 
 		 1062 aa  1296    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  40.45 
 
 		 1047 aa  696    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  46.63 
 
 		 1042 aa  798    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  45.2 
 
 		 1052 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  61.78 
 
 		 1059 aa  1243    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  44.8 
 
 		 1052 aa  815    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.35 
 
 		 1048 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  36.3 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  37.06 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  37.19 
 
 		 1045 aa  522  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  38.25 
 
 		 1037 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  37.07 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1049 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  37.02 
 
 		 1001 aa  512  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  37.57 
 
 		 1040 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  37.22 
 
 		 1054 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  38.33 
 
 		 1015 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1048 aa  493  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  35.99 
 
 		 1049 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  35.86 
 
 		 1042 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1049 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  34.45 
 
 		 1076 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  35.82 
 
 		 999 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1018 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.18 
 
 		 977 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  33.27 
 
 		 1016 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  34.17 
 
 		 991 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  31.85 
 
 		 997 aa  360  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  34.37 
 
 		 1014 aa  359  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  31.57 
 
 		 997 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  31.41 
 
 		 986 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.19 
 
 		 993 aa  315  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  30.58 
 
 		 980 aa  304  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  35.26 
 
 		 1000 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33.68 
 
 		 988 aa  220  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  34.98 
 
 		 991 aa  183  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.47 
 
 		 911 aa  147  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  32.47 
 
 		 959 aa  138  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  21.45 
 
 		 914 aa  137  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.54 
 
 		 890 aa  107  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.46 
 
 		 976 aa  95.5  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.03 
 
 		 957 aa  92.8  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.62 
 
 		 962 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.96 
 
 		 947 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.31 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  33.1 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.25 
 
 		 836 aa  57.4  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  32.26 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.6 
 
 		 919 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  25.28 
 
 		 991 aa  53.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.08 
 
 		 958 aa  52.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.85 
 
 		 989 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.12 
 
 		 957 aa  50.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.48 
 
 		 779 aa  50.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.47 
 
 		 858 aa  49.7  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  21.04 
 
 		 862 aa  48.5  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.58 
 
 		 994 aa  48.5  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  21.45 
 
 		 872 aa  48.1  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  37.21 
 
 		 142 aa  48.5  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  31.05 
 
 		 864 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  33.08 
 
 		 299 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 1059 aa  46.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.43 
 
 		 1145 aa  46.2  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.02 
 
 		 1048 aa  45.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  29.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 1135 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.23 
 
 		 994 aa  44.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>