More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3959 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  40 
 
 		 1155 aa  816    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  39.97 
 
 		 1147 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  40.68 
 
 		 1164 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  47.61 
 
 		 1180 aa  973    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  100 
 
 		 1183 aa  2372    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  93.49 
 
 		 1183 aa  2199    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  41.2 
 
 		 1161 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  60.44 
 
 		 1189 aa  1314    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  40.99 
 
 		 1156 aa  750    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  48.16 
 
 		 1180 aa  962    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  40.36 
 
 		 1161 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  47.7 
 
 		 1180 aa  971    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 		 1164 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  40.26 
 
 		 1159 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  38.73 
 
 		 1162 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  65.48 
 
 		 1182 aa  1488    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  48.46 
 
 		 1177 aa  950    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.86 
 
 		 1156 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  38.92 
 
 		 1165 aa  635  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  39.98 
 
 		 1147 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 1202 aa  629  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  39.9 
 
 		 1147 aa  628  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  40.08 
 
 		 1187 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  38.04 
 
 		 1157 aa  608  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  38.82 
 
 		 1167 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  39.28 
 
 		 1157 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  38.5 
 
 		 1151 aa  606  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  39.29 
 
 		 1157 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  36.27 
 
 		 1185 aa  572  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  36.09 
 
 		 1124 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  35.95 
 
 		 1125 aa  542  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  35.14 
 
 		 1183 aa  542  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  34.89 
 
 		 1121 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.29 
 
 		 1157 aa  532  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  36.2 
 
 		 1119 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  35.35 
 
 		 1120 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  33.92 
 
 		 1161 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  40.15 
 
 		 1106 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  33.72 
 
 		 1166 aa  452  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  39.69 
 
 		 1106 aa  446  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  29.99 
 
 		 1089 aa  435  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 854 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.06 
 
 		 860 aa  381  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  36.5 
 
 		 1142 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 1147 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  30.22 
 
 		 1173 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1177 aa  238  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 1173 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.22 
 
 		 1197 aa  220  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.59 
 
 		 1089 aa  211  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.01 
 
 		 907 aa  196  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  29.44 
 
 		 1187 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.7 
 
 		 1086 aa  178  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 1121 aa  164  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1117 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 1087 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1057 aa  159  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 1165 aa  156  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1095 aa  152  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1115 aa  145  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 1103 aa  145  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.13 
 
 		 1251 aa  145  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1061 aa  142  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1185 aa  140  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  25.37 
 
 		 1173 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  26.9 
 
 		 1248 aa  135  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.44 
 
 		 1218 aa  133  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 1149 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 1080 aa  129  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  27.95 
 
 		 1282 aa  128  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  27.62 
 
 		 921 aa  127  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  27.42 
 
 		 921 aa  125  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  25.49 
 
 		 1131 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.04 
 
 		 1230 aa  121  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  26.32 
 
 		 1244 aa  121  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 1101 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 1101 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  26.57 
 
 		 921 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.55 
 
 		 1230 aa  119  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.58 
 
 		 1217 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.94 
 
 		 1226 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  27.12 
 
 		 1242 aa  116  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 1047 aa  115  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.7 
 
 		 1204 aa  114  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.77 
 
 		 1207 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.75 
 
 		 921 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  26.33 
 
 		 1241 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.63 
 
 		 1241 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  27.13 
 
 		 933 aa  112  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  23.09 
 
 		 1110 aa  110  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.19 
 
 		 1110 aa  110  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 		 1074 aa  110  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 705 aa  110  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  24.32 
 
 		 1270 aa  109  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  25.4 
 
 		 1217 aa  109  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  25.4 
 
 		 1217 aa  109  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.8 
 
 		 1241 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.39 
 
 		 1233 aa  107  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.76 
 
 		 1271 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  22.17 
 
 		 1161 aa  107  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>