More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3957 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  96.15 
 
 
442 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  100 
 
 
442 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  73.98 
 
 
470 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  73.98 
 
 
447 aa  624  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  66.82 
 
 
442 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  66.59 
 
 
442 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  67.67 
 
 
430 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  66.74 
 
 
440 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  50.57 
 
 
440 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 
441 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  52.76 
 
 
441 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  51.84 
 
 
441 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  51.84 
 
 
441 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  52.3 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  49.31 
 
 
438 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  50.92 
 
 
438 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  51.84 
 
 
447 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  50.56 
 
 
441 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  47.82 
 
 
442 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  49.2 
 
 
442 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  48.85 
 
 
448 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  47.25 
 
 
442 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  50.8 
 
 
444 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  49.2 
 
 
447 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  47.93 
 
 
448 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  47.24 
 
 
447 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  47.79 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  46 
 
 
421 aa  349  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  46.17 
 
 
435 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  45.79 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  46.03 
 
 
437 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  46.17 
 
 
424 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  44.7 
 
 
453 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  46.03 
 
 
412 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  45.48 
 
 
424 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  42.62 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
432 aa  312  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  43.81 
 
 
437 aa  296  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  44.78 
 
 
422 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  42.09 
 
 
397 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  37.53 
 
 
434 aa  266  4e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  40 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.33 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  39.69 
 
 
443 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  35.94 
 
 
435 aa  250  3e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.5 
 
 
426 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  34.32 
 
 
442 aa  228  2e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
425 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.57 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.14 
 
 
438 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 
431 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
429 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  34.97 
 
 
418 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.55 
 
 
427 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
418 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
425 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 
434 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.17 
 
 
466 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.94 
 
 
427 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.68 
 
 
428 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
451 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.69 
 
 
424 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.39 
 
 
437 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.39 
 
 
435 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.77 
 
 
430 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.33 
 
 
422 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.45 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 
432 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.87 
 
 
431 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  31.64 
 
 
426 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 
432 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.55 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  30.48 
 
 
432 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.09 
 
 
441 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.62 
 
 
426 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  31.31 
 
 
429 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  31.24 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  38.89 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.03 
 
 
424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  32.95 
 
 
422 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
423 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.76 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  29.17 
 
 
423 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
428 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  30.82 
 
 
404 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 
425 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  29.04 
 
 
423 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
428 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.42 
 
 
436 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.67 
 
 
421 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>