271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3952 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  94.44 
 
 
252 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  65.75 
 
 
254 aa  354  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  64.54 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  53.63 
 
 
251 aa  264  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  50.2 
 
 
253 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  50.2 
 
 
255 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  52.59 
 
 
253 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  40.96 
 
 
266 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  190  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  46.89 
 
 
247 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  43.04 
 
 
278 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  40.93 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  41.03 
 
 
244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  41.53 
 
 
278 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  40.74 
 
 
241 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  42.62 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  40.74 
 
 
260 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  41.35 
 
 
278 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  40.68 
 
 
256 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  40.25 
 
 
249 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  43.88 
 
 
198 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  38.27 
 
 
263 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  35.32 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  37.61 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  37.7 
 
 
256 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  39.91 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  38.05 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  35.87 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  34.98 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  37.72 
 
 
228 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  30.65 
 
 
252 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  36.73 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  33.91 
 
 
233 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.31 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  33.04 
 
 
239 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  31.6 
 
 
286 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.05 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  29.73 
 
 
239 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.58 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  30.4 
 
 
252 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  30.73 
 
 
237 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  27.95 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.29 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  29.03 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.4 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.75 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  27.98 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  27.97 
 
 
316 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.87 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.45 
 
 
292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  31.84 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.54 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  27.54 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.52 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.81 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.51 
 
 
292 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  31.3 
 
 
236 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.51 
 
 
292 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  44.34 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  27.87 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  29.46 
 
 
240 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.63 
 
 
223 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.56 
 
 
238 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 
246 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  41.11 
 
 
243 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  27.07 
 
 
227 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  40.57 
 
 
224 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.02 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  26.29 
 
 
227 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.33 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.95 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  25.82 
 
 
227 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  36.04 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.29 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  28.98 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  26.03 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.63 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  33.05 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.94 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.98 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.42 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27.18 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  25.47 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  35.22 
 
 
235 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  26.89 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  36.11 
 
 
221 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  25.94 
 
 
235 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>